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1,200～1,500個程度の細胞をシングルセル化！劇的にシングル解析が変わります！

SmartChipテクノロジーによるシングルセル解析システム
ICELL8 cx Single-Cell System

ICELL8 cx Single - Cell Systemでシングルセル解析が劇的に変化します。わずか4 cm×4 cmのSmartChipに搭載された5,184個の各ウェルがナノサイズの反応チュ ーブであり、マルチサンプル・ナノディスペンサー(MSND)によって精密な分注が行われます。専用のCellSelectソフトウェアが生きたシングルセルを含むウェルを 自動選択するため、実験者間の偏りのない、シングルセルおよび生死判別が可能です。

特長

  • 5,184個のウェルに細胞を分注し、最大1,200～1,500個程度の細胞をシングルセル化
  • 5～100 μmの幅広い細胞サイズに対応。シングルセル化効率は細胞サイズに依存しません
  • 専用ソフトウェアで確実なシングルセルのみを選択
  • 最大8種類の細胞サンプルを1枚のSmartChip上で一度に解析可能
  • 解析したいサンプルのみを選択できるため、シングルセル解析で問題となるNGS解析コストを抑えることが可能
カタログ番号 品名 容量
640189 ICELL8 cx Single-Cell System １式
640142 ICELL8 Chip and Reagent Kit v2 １キット
SmartChipテクノロジー

5,184個の微小ウェル（100 nl/well）が搭載されたSmartChip上に、MSNDによる数10ナノリットルの精密な分注（ナノディスペンシング）を行うことにより、ハイスループットかつ再現性の高い解析を可能にする技術です。
細胞の分注はポアソン分布に従って行われ、1,200～1,500個程度のシングルセルを獲得することができます。また、1回の分注で8種類までのサンプルを分注できます。分注は15分程度で完了するため、細胞の生存率への影響を最小限に抑えることができます。

自動イメージング

MSNDによる分注後、各ウェルのイメージは15分以内に自動で取得されます。
得られた画像データから、専用のCellSelectソフトウェアによる各ウェル内の細胞数の検出、生死の判定が自動的に行われます。
選択したウェルのみに対して反応試薬を分注可能なため、NGS解析コストを削減することができます。

サイズの異なる細胞集団を同時に解析

ICELL8システムによる分注操作は細胞のサイズ制限を受けず、5～100 μmの細胞を均一に分注することが可能です。ICELL8システムを用いた混合細胞サンプルの遺伝子発現解析結果は、個々の細胞特有のプロファイルを示していました。 詳細は技術資料ご覧ください。

全長トランスクリプーム解析例

SMARTer-Seq技術の圧倒的な感度と、ICELL8システムを組み合わせることで、大量のシングルセルから高品質なscRNA-seqデータを生成します。本システムを用いて調製されたライブラリーは、シーケンスdepthが低い場合においても多数の転写物および遺伝子を検出します。さらに、ダウンサンプリングした場合でも、ライブラリーの複雑さを維持します。(全長RNA-seq専用キットは2018年5月以降発売予定)

使用実績のある細胞リスト

Cell line/type Species Source Cell line/type Species Source
307 Mouse Pancreas KU812 Human Blood, CML myeloblast
3T3 Mouse Fibroblast Lung epithelia Mouse Primary FACS-sorted cells
A-20 Mouse B-lymphocyte MCF7 Human Breast
A-375 Human Melanoma MDA-MB-231 Human Mammary gland
BaF/3 Mouse Pre-B cells MIA PaCa-2 Human Pancreas
Beta-TC-6 Mouse Pancreas Nasal epithelia Human Primary nasal scraping
Primary cells Mouse Bone marrow NCH421K Human Glioma/glioblastoma
Primary cells Mouse Cardiomyocyte (adult) Neurons Mouse Fresh dissection
CHO Hamster Ovary Nuclei Human Frozen lung tumor;
frozen breast cancer
ESC; Differentiated
ESC		 Mouse Embryonic stem cells PBMCs Human Blood
Ear Mouse Inner ear organs Planaria SC Planarium Stem cells
Primary cells Mouse Embryos Retina Mouse Primary cells
FACS-sorted lymphocytes Human Bone marrow Scheider S2 Drosophila Embryo
Fetal cortex Human Primary cells SK-BR3 Human Breast
Fetal neurons Human Fetal brain Skin Zebrafish Skin
Gut cells Mosquito Gut Spheroids Human MCF10CA-derived
H2452 Human Lung U-87-MG Human Glioblastoma; astrocytoma
HCT 116 Human Colon UTHSC Human Bone marrow EW-8 Ewing
Sarcoma
HSPC Mouse Hematopoietic stem cells Z-138 Human B-cell lymphoma
ICELL8システムの大口径ノズルで、幅広い細胞サイズのサンプルをバイアスなく分離可能
ICELL8システムで単離した細胞種の一例です。青色で示したサンプルは、ICELL8システムが初めて単離に成功したシングルセル、核、スフェロイドです。

MultiSample NanoDispencer(MSND)によるナノディスペンシング

MultiSample NanoDispenser(MSND)は、5,184個の微小ウェルが搭載されたSmartChip上に、数10ナノリットルの精密な分注（ナノディスペンシング）を行ないます。
分注は15分程度で終了するため、細胞への影響を最小限に抑えることができます。

ユーザによるレビュー：Sten Linnarsson教授(カロリンスカ研究所,スウェーデン)

2016年のAGBT(Advances in Genome Biology and Technology)で行われた、スウェーデン カロリンスカ研究所 (Karolinska Institutet)のSten Linnarsson教授の発表をご覧ください。
マウス脳を分子生物学的に解剖することを目的とした一連の研究において、組織サンプルのシングルセル解析は大きな役割を担っています。「ICELL8 Single-Cellシステムでの細胞の単離は約2日間で終了する。これは以前は数ヶ月かかっていた。」とSten Linnarsson教授は語っています。

システム構成・内容

  • ICELL8 cx Single-Cell System
    ・ICELL8 cx システム本体
    ・CellSelect Software
    ・Chip Cycler
    ・制御解析用PC
品名 ICELL8 cx Single-Cell System　本体
外寸法 107(Ｗ)×56(Ｄ)×56(Ｈ) cm
重量 79.4kg
電源 AC100～240V, 50/60Hz, 3.6A(100V時)
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